Предполагая, что вы работаете на управляемом языке, компиляция в «AnyCPU» должна быть кросс-платформенной (64/32 бит), потому что сгенерированный IL не превращается в машинные инструкции, пока код не будет JITted при его запуске.
Есть очень мало исключений, когда вы можете получить зависимости от бит-ness, если используете определенные конструкции, которые зависят от размера указателей и т. Д., Но они обычно не появляются в вашем коде, хотя было бы не повредить запуск FxCop над вашим код (убедитесь, что в FxCop есть раздел, посвященный переносимости, который охватывает эти проблемы)