Контекстный корень определяется файлами XML в WAR. Проверьте sun-web.xml, который должен определить это.
1
Когда вы используете Netbeans, вы можете выбрать корень контекста в свойствах проекта / run. Когда вы развертываете его через администратора Glassfish, вы можете ввести его там.