Попробуйте удалить папку .gradle в своем проекте и перезапустить Android Studio.
Я впервые установил студию Android на Windows 7, и я получил эту ошибку:
Gradle 'MyApplication5' project refresh failed
Error:Unexpected lock protocol found in lock file. Expected 3, found 0
java,android-studio,gradle,developer-tools,yolk,
Попробуйте удалить папку .gradle в своем проекте и перезапустить Android Studio.