Интерактивная консоль в PyDev будет использовать консоль IPython по умолчанию, если вы ее установили.
Вы можете начать с Ctrl+Alt+Enter
и отправить содержимое из открытого редактора по строкам в консоль F2
.
Подробнее см. В http://www.pydev.org/manual_adv_interactive_console.html для интерактивной консоли.